Dr. Alper Alkan, çok sayıda TÜBİTAK, Kalkınma Bakanlığı, KOSGEB, SANTEZ ve Üniversitelerin Bilimsel Araştırma Projelerinde yürütücü, araştırmacı ve danışman olarak yer almıştır. Ulusal ve Uluslararası alanda 300’ün üzerinde yayın ve bildirisi, bilim ödülleri ve konferansları bulunmaktadır. Çeşitli bilimsel dergilerin yayın ve danışma kurulu üyesi olarak görev yapmaktadır. Profesyonel olarak dentofasiyal deformiteler, dudak damak yarıkları, temporomandibular eklem cerrahisi, maksillofasiyal travma ve implant cerrahisi ile ilgilenmektedir. Erciyes Üniversitesi Yönetim Kurulu, yapmış olduğu üstün hizmetlerden ve Ülkemizin diş hekimliği alanındaki tek branş hastanesinin planlamasından, yapımına ve işletilmesine kadar olan katkılarından dolayı Ağız ve Çene Cerrahisi Hastanesi bünyesinde bulunan genel ameliyathane ünitesinin adının ‘’Prof. Dr. Alper Alkan Ameliyathanesi’’ olarak belirlenmesine oybirliği ile karar vermiş ve Dr. Alkan’ı yaşarken onurlandırmıştır. Dr. Alkan, evli ve ikiz çocuk babasıdır.